KARACADAĞ BÖLGESİ ZOM KOYUNLARININ MİTOKONDRİYAL ND4 (NADH DEHİDROGENAZ ALTUNİTE 4) GENİNİN MOLEKÜLER GENETİK ANALİZİ

Abstract

Bu çalışmada, Diyarbakır Karacadağ yöresinde yetiştirilen ve akrabalık ilişkisi bulunmayan Zom ırkı koyunlarda mitokondriyal ND4 (NADH dehydrogenase subunit 4) geninde moleküler analizler yapılmıştır. Koyunlarda mitokondriyal ND4 proteini (NP_008415) 459 amino asitten oluşmaktadır. ND4 proteini, NADH'den elektron transferini katalize eden mitokondriyal membran solunum zinciri NADH dehidrojenazın (Kompleks I) çekirdek alt birimdir. ND4 proteini ND4 geni tarafından kodlanır. Koyun ND4 geni 1377 bp uzunluğundadır (Gen ID: 808257 Lokasyon: 10175-11542). Koyunlardan, kan genomik DNA izolasyon kiti kullanılarak DNA izolasyonu yapılmıştır. ND4 geninin PCR çalışmasında 858 bp uzunluğunda PCR ürünleri elde edilmiştir. Mitokondriyal ND4 geninde DNA sekans analizi yapılmıştır. DNA dizi analizine göre, Zom koyun ırkında ND4 geninde polimorfik olduğunu ve bu gen üzerinde A375G, C610T, G678A ve G750A mutasyonları tespit edilmiştir. Koyun mitokondriyal ND4 protein modeli incelendiğinde, mutasyonların (silent) proteininin yapısı ve özelliğinde önemli değişimlere neden olmadığı tespit edilmiştir. Koyunlarda ilgili genomik bölgelere yönelik çalışmalarda mutayonların araştırılmasının yararlı olacağı düşünülmektedir.