ĠVESĠ KOYUNLARINDA MĠTOKONDRĠYAL CYTOCHROME OXIDASE (COX1) GEN POLĠMORFĠZMĠ

Abstract

Bu çalıĢmada, ġanlıurfa yöresi Tek Tek dağlarında yetiĢtirilen ve akrabalık iliĢkisi bulunmayan Ġvesi ırkı koyunlarda mitokondriyal cox1 (cytochrome c oxidase subunit I) geninde moleküler analizler yapılmıĢtır. COX proteinleri, oksidatif fosforilasyonu düzenleyen mitokondriyal elektron taĢıma zincirindeki son enzim olan sitokrom c oksidazın bileĢenleridir. COX1 proteini cox1 geni tarafından kodlanır. Koyunlarda mitokondriyal COX1 proteini (NP_008480) 514 amino asitten oluĢmaktadır. Koyun cox1 geni 1514 bp uzunluğundadır (Gen ID: 808251, lokasyon: 5332-6876). DNA izolasyonu, koyunlardan alınan kandan, kandan genomik DNA izolasyon kiti kullanılarak yapılmıĢtır. cox1 geninin PCR çalıĢmasında 761 bp uzunluğunda DNA fragmentleri elde edilmiĢtir. Mitokondriyal cox1 geninde DNA sekans analizi yapılmıĢtır. DNA dizi analizine göre, Ġvesi koyun ırkında cox1 geninin polimorfik olduğunu ve bu gen üzerinde; T432C, T453C, T570C ve T647C mutasyonları tespit edilmiĢtir. Koyun mitokondriyal COX1 protein modeli incelendiğinde, mutasyonların (silent) proteininin yapısı ve özelliğinde önemli değiĢimlere neden olmadığı tespit edilmiĢtir. Koyunlarda ilgili genomik bölgelere yönelik çalıĢmalarda mutayonların araĢtırılmasında yarar olacağı düĢünülmektedir.