Şanlıurfa, Diyarbakır, Mardin ve Adıyaman illerinde biber (Capsicum annuum L.) bitkilerinden endofitik bakterilerin karakterizasyonu ve önemli bazı hastalıklara karşı antagonistik aktivitelerinin belirlenmesi / Characterization and identification of endophytic bacteria isolated and antagonistic activity to some important pathogens from pepper (Capsicum annuum L.) Plants in Sanlıurfa, Diyarbakır, Mardin and Adıyaman

Abstract

Bu çalışmada, Şanlıurfa, Mardin, Diyarbakır ve Adıyaman il ve ilçelerinde biber kök ve kök boğazından 89 endofitik bakteri izole edilmiĢ ve bunların belli başlı fungal patojenlere (Fusarium solani, Rhizoctonia solani, Fusarium oxysporum ve Macrophomina phaseolina) karşı antagonistik aktivitelerini belirlenmiştir. Laboratuvar koşullarında etkinliği tespit edilen bakteri suşlarının in vivo koşullarda iklim odasında saksı denemeleriyle ve tarla denemeleri ile etkinlikleri test edilmiştir. Endofitik izolatların patojenlere karĢı % inhibisyon oranları Macrophomina phaseolina'ya karşı % 98.15 ile % 2.77, Fusarium solani'ye karşı %96,66 ile % 0, F. oxysporum'a karşı %95,23 ile %0, Rhizoctonia solani'ye %95 ile % 0 arasında farklılık göstermişlerdir. Matriks yardımlı lazer desorpsiyon iyonizasyon-uçus süreli kütle spektroskopi (MALDI-TOF MS) cihazı ile in-vitro çalışmalar sonucu etkili bulunan A4E14, B20 ve S1E izolatlarının Stenotrophomonas maltophilia olduğu; BSÇ8, S2E9, U2E5, K1E11, A5E11ve U2E4'ün Bacillus cereus; H4E4, A5E10, H4E8, H3E3, S1E16 ve H2E10'un Pseudomonas aeruginosa; ve A1E2'nin Pseudomonas thivervalensis olduğu tespit edilmiştir. İn-vivo yapılan çalışmalar sonucunda toprağa inokule edilen izolatlardan Pseudomonas aeruginosa, Bacillus cereus ve Pseudomonas thivervalensis‟in karışımlarının ve Stenotrophomonas maltophilia izolatının diğer endofitik bakteri izolatlarına ve kontrole göre verime ve hastalıklara karşı daha etkili olduğu gözlemlenmiştir. Etkili bulunan bakteri suşları daha sonra ticari olarak kullanılmak üzere değerlendirilecektir.